همسرش طاهره کلباسی بود که او هم دو سال بعدتر درگذشت. حسین، محسن، مهدی، راضیه، انسیه، مرضیه، علیرضا، کبری و محمدحسین فرزندان او هستند. ابوالقاسم خزعلی جزء معدود روحانیونی بود که بعد از انقلاب حمایتش را از انجمن حجتیه پنهان نکرد و در جلسات آنها شرکت میکرد.
