شبح افراط گرایی اهل سنت کماکان ایران را نگران می‌کند. پیروزی طالبان موهبتی برای ستیزه جویان سنی در سراسر منطقه بود. این طیف تشیع را یک انحراف و بدعت و خارج شده از اسلام قلمداد می‌کند. اگرچه طالبان اکنون آشکارا از خصومت با تشیع حمایت نمی‌کند و با ایران رابطه برقرار کرده، اما هزاره‌های شیعه را از مشاغل دولتی پاکسازی کرده است. اگرچه حملات اخیر علیه شیعیان کار داعش شاخه خراسان است، اما ظرفیت درگیری فرقه‌ای گسترده‌تر در افغانستان وجود دارد.
