ترکیب اعضای دو کمیسیون یکسان بوده و ریاست هر دو کمیسیون چه در ساختار پیشین و چه در ساختار جدید بر عهده وزیر راه و شهرسازی است. بر این اساس، مدیریت این حوزه همچنان در اختیار وزارت راه و شهرسازی باقی مانده و هیچگونه تضعیف یا حذف در نقش این وزارتخانه در فرآیندهای سیاستگذاری و تصمیمسازی صورت نگرفته است.