جواد طباطبایی در تحلیل مشکلات ایران معتقد بود که ایران با وجود پیشگام بودن در ایجاد قانون اساسی مدرن در دنیای اسلام، همچنان درگیر چالشهای بنیادین فکری و سیاسی است. او ایدئولوژی را مانعی برای تفکر انتقادی میدانست و به نقد همیشگی آن در اندیشه خود میپرداخت.