آیتالله مصباح در دوره نخست دولت احمدینژاد و تا سال ۸۸ از حامیان وی بود، اما به تدریج با پدیدار شدن جریان انحرافی در دولت و قدرت گرفتن اسفندیار رحیممشایی، وی و شاگردانش از جمله سیدمحمود نبویان به جدیترین منتقدان احمدینژاد و جریان انحرافی تبدیل شدند