مدیران عامل برخی مناطق آزاد کشور از سایر دستگاههای دولتی از جمله شرکت فرودگاهها و ناوبری هوایی ایران، سازمان برنامه و بودجه، سازمان سرمایه گذاری و کمکهای اقتصادی و فنی ایران و... به مناطق آزاد مامور شدهاند، اما قالیباف رییس مجلس در نامهای به روحانی رییس جمهوری این تصمیم را مغایر با قانون اعلام کرد.