عمر دوران حضور سعید مهری در آپوئل و فوتبال قبرس خیلی کوتاه بود و بازیکن سابق استقلال که در تفکرات سرمربی جدید جایی نداشت، از این تیم جدا شد.
یک روز پس از قرعهکشی مرحله گروهی لیگ کنفرانس، باشگاه آپوئل پایان همکاری خود با سعید مهری را اعلام کرد. او که در نیمفصل دوم لیگ قبل از استقلال به آپوئل پیوست تا به همکاری خود با ریکاردو ساپیتو ادامه دهد، دوران موفقی را در این تیم نداشت.
البته مهری توانست با آپوئل در پایان فصل عنوان قهرمانی لیگ را کسب کند اما با جدایی ساپینتو، سرمربی جدید نیز روی نام مهری خط کشید هر چند که مصدومیت او در اردوی تیم ملی نیز باعث دوری طولانیمدت و از دست دادن تمرینات پیشفصل شده بود.