در پیام رهبر معظم انقلاب در پی درگذشت حجت‌الاسلام فاطمی‌نیا آمده است: اطلاعات گسترده و بیان جذاب و لحن شیرین این عالم محترم، منبعی پرفیض برای جمع زیادی از جوانان و راهجویان بود و فقدان آن مایه‌ی تأسف و اندوه است.
رهبر معظم انقلاب با صدور پیامی درگذشت عالمِ واعظ حجت‌الاسلام آقای حاج سیّدعبدالله فاطمی‌نیا را تسلیت گفتند.
به گزارش پایگاه اطلاع رسانی مقام معظم رهبری، متن پیام به این شرح است:
بسم الله الرحمن الرحیم
درگذشت عالمِ واعظِ درس‌آموز، جناب حجت‌الاسلام آقای حاج سیّد عبدالله فاطمی‌نیا رضوان‌الله علیه را به خاندان گرامی و همه‌ی صاحبان عزا و ارادتمندان و مستفیدان ایشان تسلیت عرض می‌کنم. اطلاعات گسترده و بیان جذاب و لحن شیرین این عالم محترم، منبعی پرفیض برای جمع زیادی از جوانان و راهجویان بود و فقدان آن مایه‌ی تأسف و اندوه است. از خداوند متعال مسألت می‌کنم که رحمت و غفران خود را شامل حال ایشان فرماید و پاداش وافر به ایشان عنایت کند.
سیّدعلی خامنه‌ای
۲۶ اردیبهشت ۱۴۰۱
روح استاد فاطمی نیا شاد و شفاعت قرآن کریم و عترت اطهار نصیبشان باد ان شآء الله.