تخریب زیست گاه، آلودگی، تعارض با انسان و گونه‌های غیر بومی از جمله عوامل تهدید لاک پشت‌ها هستند. دو گونه لاک پشت غیر بومی از دو دهه قبل وارد ایران شده و گونه‌های بومی را درمعرض تهدید قرار داده‌اند.
۱۰ گونه لاک پشت در ایران وجود دارد که پنج گونه از آنها دریایی، دو گونه خشکی زی و سه گونه هم برکه‌ای هستند و درنقاط مختلف کشور پراکنده‌اند. دریایی‌ها در خلیج فارس و دریای عمان پراکنش دارند. این خزندگان نیز مانند همه موجودات، نقش مهم و موثری در چرخه حیات بازی می‌کنند. خشکی زی‌ها گیاه خوارند و دانه گیاهان و میوه‌هایی که از آنها تغذیه می‌کنند، از طریق مدفوعشان در نقاط مختلف گسترش می‌یابد و موجب پخش دانه‌ها و رشد گیاهان می‌شوند.
به گزارش خبرآنلاین، لاکپشت‌های برکه‌ای همچون لاک پشت فراتی موجودات مرده داخل آب را می‌خورند و رودخانه‌ها و تالاب‌ها را تمیز می‌کنند. لاکپشت‌های دریایی مانند لاک پشت سبز دریایی، از علف‌های دریایی تغدیه کرده و از رشد بی‌رویه آنها جلوگیری می‌کنند. بستر علف‌های دریایی محیط مناسبی برای زادآوری سایر موجودات است و لازم است از رشد بی رویه این علف‌ها جلوگیری شود.
طبق بررسی‌های جهانی چند عامل مهم تمامی لاک پشت‌ها را تهدید مِی‌کند. تخریب و تکه تکه شدن زیستگاه، آلودگی زیستگاه، تعارض میان لاکپشت‌ها وانسان و تجارت غیر قانونی آنها.
بسیاری از لاک پشت‌های دریایی با انواع آلودگی‌های دریا از تهدید می‌شوند. به جز آلودگی‌های نفتی و فاضلاب ها، برخی از این موجودات در تور‌های رها شده صیادی گرفتار مِی‌شوند و دیگر نمی‌توانند خود را برای تنفس، به سطح آب برسانند و خفه می‌شوند. برخی مواقع قربانی پلاستیک‌های رها در دریا‌ها می‌شوند. لاک پشت‌های پشت چرمی از عروس دریایی تغذیه می‌کنند و گاهی اوقات پلاستیک‌ها را با عروس دریایی اشتباه گرفته، آن را خورده و می‌میرند. آتش سوزی‌های جنگل‌های زاگرس نیز مثالی از تخریب و از بین رفتن زیستگاه و حتی تهدید جان لاک پشت‌های خشکی زی در ایران است. برکه‌ای‌ها نیز عمدتا از طریق احداث سد و تکه تکه شدن زیستگاه‌شان آسیب میبینند. آنها همچنین با تغییرات ناگهانی آب دریاچه پشت سد‌ها نیز، تهدید می‌شوند.
تعارض میان انسان و حیوان هم عامل دیگری است که نمونه بارز آن، کشتن لاک پشت فراتی در خوزستان است. لاک پشت فراتی، رقیب ماهی گیران خوزستانی قلمداد می‌شد، ماهی گیران معتقد بودند یا ماهی‌ها را می‌خورد یا تور‌های صیادی را پاره میکند به همین دلیل صیادان این لاک پشت‌ها را می‌کشتند یا به آن صدمه می‌زدند. لاک پشت فراتی در فهرست سرخ اتحادیه بین المللی حفاظت از طبیعت قرار دارد و در معرض خطر انقراض است. از سال ۸۹ البته اقدامات حفاظتی و آموز ش‌هایی توسط متخصصین موسسه خزنده شناسان پارس برای ماهی گیران، محیط بانان و دانش آموزان در خوزستان انجام شده تا از این گونه در معرض خطر انقراض حافظت بیشتری شود.
دوگونه لاک پشت غیر بومی بعنوان مهمان ناخوانده از حدود ۲۰ سال قبل و توسط وارد کنندگان ماهی‌های زینتی، به ایران وارد شده‌اند. لاک پشت گوش قرمز که زادگاه اصلی اش رودخانه می‌سی سی پی امریکاست و لاک پشت لاک نرم چینی. لاک نرم چینی هم اکنون بیشتر در استان‌های شمالی بویژه میانکاله وجود دارد و گوش قرمز در اکثر استان‌ها از جمله دریاچه شورمست حضور دارد.
لاک پشت گوش قرمز، جزو ۱۰۰ گونه مهاجم اتحادیه بین المللی حفاظت از طبیعت است که می‌تواند گونه‌های بومی را از زیستگاه حذف کند. همچنین این خزنده رقیب لاک پشت برکه‌ای اروپایی است. منابع غذایی و زیست گاه مشترک با گونه لاکپشت اروپایی دارد و از آنجا که دوگونه با نیاز‌های یکسان نمی‌توانند در یک زیست گاه دوام بیاورند و قدرت سازگاری گونه مهاجم بیشتراست، گونه بومی حذف خواهد شد. گوش قرمز آنقدر مهاجم است که ورود آن به اتحادیه اروپا ممنوع شده و در استرالیا سازمان متولی حفاظت اجازه شلیک به آن را داده است.
لاک پشت لاک نرم چینی نیز بیشتر در میانکاله وجود دارد و آسیب‌هایی به حوضچه‌های پرورش ماهی زده است. این گونه بسیار شبیه به لاکپشت فراتی است و همکاران محیط زیست استان‌های مختلف کشور نیز که متوجه تفاوت‌های جزیی آنها نمی‌شوند، لاک نرم چینی را به جای لاکپشت فراتی، به خوزستان منتقل کرده‌اند. با زاد آوری این گونه‌های مهاجم در طبیعت ایران، با معضل غیر قابل حلی مواجه خواهیم شد.
