فرشید باقری در دوران حضور محمود فکری چندان مورد توجه او نبود و یکی دو بار تا آستانه جدایی هم پیش رفت با چراغ سبز فرهاد در دقایق پایانی روبه‌رو شده و به بازی برود.
در دیدار آخر استقلال با سرمربیگری محمود فکری، این مربی به فرشید باقری ۹۰ دقیقه بازی داد تا از قدرت تدافعی و بازیسازی این بازیکن در خط هافبک به ویژه روی زمین چمن مصنوعی رفسنجان به سود تیمش استفاده کند که البته اتفاق خاصی برای تیمش رخ نداد.
با این همه فرهاد مجیدی هم در دیدار با فولاد سراغ همین بازیکن رفت ولی تنها برای دقایقی اندک. احمد موسوی در دقیقه ۸۸ بازی جای خود را به فرشید باقری داد تا این بازیکن که در دوران حضور محمود فکری چندان مورد توجه او نبود و یکی دو بار تا آستانه جدایی هم پیش رفت با چراغ سبز فرهاد در دقایق پایانی روبه‌رو شده و به بازی برود.
فرشید باقری در دقایق پایانی تلاشش را کرد تا در بحث دفاعی به خط هافبک کمک کند و مانع گلزنی مهاجمان و هافبک‌های فولاد شود که ظرف دقایق پایانی فشار زیادی روی دروازه استقلال می‌آوردند.
