اولین بار علیرضا زاکانی، حامی سرسخت ابراهیم رئیسی در مناظره با مصطفی تاج‌زاده از اکبر طبری نام برد و اعلام کرد که «او همان فردی است که «بیچاره‌کننده دو رئیس قوه قضائیه» است.» و تاکید کرد که عزل او کافی نیست. طبری باید محاکمه شود. این حرف‌ها باعث شد که ردپای زاکانی در پرونده اکبر طبری نمایان شود.
هم‌میهن نوشت: پرونده اکبر طبری یکی از آن پرونده‌های جنجالی بود که قوه‌قضائیه را در دوره ریاست ابراهیم رئیسی به چالش کشید. طبری که همیشه به قضات و دیگر کارمندان قوه‌قضائیه دستور می‌داد حالا با پرونده‌ای پر و پیمان روبه‌روی قاضی مجبور به پاسخگویی شد.
ابراهیم رئیسی ۱۶ اسفند ۹۷ به‌عنوان رئیس قوه‌قضائیه، سکان دستگاه قضا را در دست گرفت و ۷ روز پس از آن اکبر طبری را برکنار کرد. اولین بار علیرضا زاکانی، حامی سرسخت ابراهیم رئیسی در مناظره با مصطفی تاج‌زاده از اکبر طبری نام برد و اعلام کرد که «او همان فردی است که «بیچاره‌کننده دو رئیس قوه قضائیه» است.» و تاکید کرد که عزل او کافی نیست. طبری باید محاکمه شود.
این حرف‌ها باعث شد که ردپای زاکانی در پرونده اکبر طبری نمایان شود؛ پرونده‌ای که گفته شد رو شده تا ابراهیم رئیسی را برای انتخابات ریاست‌جمهوری آماده کند و از او فردی ضدفساد بسازد. علیرضا زاکانی، شهردار کنونی تهران درباره نقش خود در پرونده اکبر طبری گفت: «ما اطلاعاتی از تخلفات ایشان داشتیم و آن را علنی کردیم.»
او در پاسخ به این سوال که این اطلاعات را از کجا آوردید و چطور صحت‌سنجی کردید؟ تاکید کرد: «من آن زمان مجلس بودم و پرونده‌های فساد را در کشور دنبال می‌کردم. به این قاعده قائل بودم که سراغ کسی بروم که گردن‌کلفت‌تر و شرایط قوی‌تری دارد.
دو معاون رئیس‌جمهوری - در دوره پیشین - مانند معاون اول رئیس‌جمهوری، مجمع تشخیص مصلحت نظام، وزارت اطلاعات و حتی همین آقایی که می‌گویید – اکبر طبری - از من شکایت کردند و دادگاه رفتم و به لطف خدا تبرئه هم شدم.» شهردار تهران در پاسخ به این سوال که چرا گفته می‌شود که شما این پرونده را رو کردید تا ابراهیم رئیسی را برای انتخابات ریاست دولت تطهیر و آماده کنید؟ گفت: «این ظن و گمان نادرستی است.»
زاکانی با اشاره به اینکه نگاه سیاسی به این پرونده‌ها نداشته، افزود: «من از سال ۸۰ به موضوع آقای جاسبی و سعید مرتضوی – معروف به قاضی مرتضوی – پرداختم. این افراد متعلق به چه جناحی هستند؟ به فریدون برادر آقای روحانی، مهدی برادر آقای جهانگیری هم پرداختم و از این دست پرونده‌ها زیاد است.»
او در حالی این پرونده‌ها را مطرح می‌کند که گفته می‌شد در زمان خود موضوعات سیاسی بسیاری را پشت خود پنهان کرده بودند و برخی اعلام می‌کردند این پرونده‌ها در بزنگاه‌های تاریخی مطرح شده تا به امتیازگیری سیاسی منتج شود.
