بر اساس توافق وزیران خارجه ایران و ژاپن، شورای همکاری بین دو کشور تشکیل می‌شود.
بعد از دیدار وزیران خارجه ایران و ژاپن بیانیه مشترک این دو مقام عالی رتبه پیرامون همکاری‌های دو جانبه میان دو کشور منتشر شد که در این بیانیه خبر از تشکیل شورای همکاری ایران و ژاپن داده شد.
در این راستا عنوان شده که طرفین در زمینه ایجاد شورای همکاری ایران و ژاپن که در برگیرنده حوزه های وسیعی از همکاری های دو جانبه خواهد بود، توافق کردند. این اقدام در راستای تقویت و توسعه در قالب همکاری و تبادل اطلاعات میان وزارت خانه و سایر نهادهای ذی‌ربط صورت خواهد گرفت و طرفین بر اساس جدول مشخص شده اقدام به ایجاد گروه های کاری در حوزه های مورد نظر همکاری از جمله محیط زیست، همکاری اقتصادی، تجارت و سرمایه گذاری، بهداشت و درمان و... به منظور تقویت و پیشبرد همکاری ها خواهند نمود.
بر اساس این گزارش طرفین از توافق اصولی حاصله در مذاکرات پیرامون انعقاد موافقت‌نامه سرمایه‌گذاری دو جانبه ( مشترک) میان جمهوری اسلامی ایران و ژاپن که سپتامبر 2015 و به منظور حمایت از سرمایه‌گذاران دو کشور در راستای تقویت هر چه بیشتر مناسبات اقتصادی میان ایران و ژاپن آغاز شده، استقبال کردند. در عین حال طرفین تاکید کردند تلاش های بیشتری را به منظور نهایی کردن و اجرایی کردن هر چه بیشتر این توافق به کار خواهند گرفت.
در این بیانیه همچنین اشاره شده طرفین در زمینه همکاری پیرامون ایمنی هسته‌ای و اجرای پادمان های آژانس بین‌المللی انرژی اتمی و اقدامات شفاف به منظور حمایت از ایران در اجرای برنامه جامع اقدام مشترک در همکاری نزدیک با آژانس بین‌المللی انرژی اتمی در خلال روند اجرایی کردن توافق نهایی در قالب برجام در ارتباط با موضوع هسته‌ای ایران توافق کردند و پس از نخستین روز اجرایی شدن برجام بر اساس زمان تعیین شده در برجام، طرفین در زمینه اجرایی کردن موارد زیر همکاری خواهند کرد:
1- ایجاد فرصت برای اعضای مرکز نظارت هسته‌ای و متخصصان به منظور مطالعه اهمیت مقابله با حوادث در مراکز هسته‌ای و ایجاد سازه‌های مقاوم در برابر زلزله به منظور تقویت ایمنی هسته‌ای.
2- اعزام متخصصان (کارشناسان) و ارائه برنامه های آموزشی به عنوان یک اقدام حمایت در راستای ایجاد مرکز ایمنی هسته‌ای به گونه ای که در برنامه جامع اقدام مشترک مورد اشاره قرار گرفته است.
3- حمایت از توسعه منابع انسانی از طرف اجرای برنامه‌های آموزشی در زمینه هسته‌ای با تمرکز بر نگهداری و نظارت بر مواد هسته‌ای .
به گزارش ایسنا، در بیانیه مشترک وزرای خارجه دو کشور ایران و ژاپن عنوان شده که طرفین به عنوان دو عضو مسئول جامعه بین‌المللی بار دیگر بر نقش سازنده خود در ارتباط با تقابل با چالش های حاضر در سطح بین‌المللی تاکید کردند. وزرای خارجه در خصوص راه های تقویت هر چه بیشتر مناسبات دوستانه و دیرینه میان ایران و ژاپن نیز بحث و تبادل نظر کرده و در ارتباط با موضوعات منطقه‌ای و جهانی گفت‌وگو کردند.
طرفین همچنین علاقمندی خود را در زمینه ادامه همکاری در موضوعات دو جانبه، منطقه‌ای و بین‌المللی بر اساس بیانیه مشترک صادره از سوی وزرای خارجه دو کشور در خلال دیدار رسمی وزیر خارجه ژاپن از تهران در تاریخ 19 آبان 1392 و همچنین بیانیه مشترک مطبوعات در خلال دیدار رسمی ظریف از توکیو در تاریخ 15 اسفند 1393 ابراز کردند.
دو طرف همچنین در ارتباط با زمینه های همکاری و تقویت روابط دو جانبه و توسعه مناسبات توافق‌هایی داشته‌اند.
